Do chưa có quy định trạm thu phí phải nằm trong dự án BOT nên một số trạm đặt bất hợp lý, công trình một nơi, thu phí một nẻo. Dẫn đến trường hợp người dân phải trả tiền kể cả khi đi qua đường tránh
Theo đại diện Ban Quản lý các Khu chế xuất và công nghiệp TP HCM, so với các dự án nhà ở thông thường, việc xây dựng NOXH phức tạp hơn. Chẳng hạn như việc chọn địa điểm xây dựng, nếu NOXH được quy hoạch ở những khu vực quá xa trung tâm như Củ Chi thì sẽ không khả thi do di chuyển hàng ngày bất tiện.