Tại khu vực rừng của Vườn Quốc gia Cúc Phương đoạn nằm trên địa bàn hành chính xã Thành Yên, khá nhiều cây lớn bị đốn hạ, một số gỗ vẫn chưa được vận chuyển đi nằm rải rác ven con đường mòn.
Trước quy hoạch tầm nhìn 100 năm, một khu dân cư nằm ở ngã tư Khuất Duy Tiến - Nguyễn Trãi, đoạn quanh di tích Gò Đống Thây đã nằm trong quy hoạch và có thể sẽ phải di dời.