Giai đoạn 2010 - 2015, Sở Xây dựng Thanh Hóa đã bổ nhiệm một số trưởng phòng, phó trưởng phòng chưa đủ tiêu chuẩn. Thời điểm cuối năm 2015, Sở này thừa 6 phó trưởng phòng.
Khu nhà ở IDC Yên Phụ được xúc tiến đầu tư từ năm 1990, đến nay chưa thể triển khai do vướng mắc GPMB và các quy định về đê điều. Vừa qua, dự án này nằm trong diện tạm dừng theo chỉ đạo của Hà Nội, do nằm trong ranh giới nghiên cứu thực hiện Trục đại lộ cảnh quan sông Hồng.