Theo Cục Hàng không, có hai phương án đầu tư đồng bộ sân bay Côn Đảo bao gồm phương án 1 theo Luật Đầu tư, Luật Đầu tư công và phương án 2 theo Luật Đầu tư PPP.
Theo điều chỉnh quy hoạch, đường băng sân bay Côn Đảo sẽ được nâng cấp, mở rộng để khai thác được máy bay loại lớn hơn như Airbus A320, A321 thay cho máy bay ATR 72 và tương đương như hiện nay.