Theo quy hoạch, có ba tuyến đường sắt liên vùng đi qua TP Thủ Đức gồm tuyến đường sắt Trảng Bom - Hòa Hưng; đường sắt tốc độ cao Sài Gòn - Nha Trang và tuyến đường sắt nhẹ Thủ Thiêm - Cảng hàng không quốc tế Long Thành.
Hà Nội sắp xây dựng nút giao của đường dẫn lên cầu Tứ Liên và ba nhánh cao tốc gồm: Vành đai 3, Cao tốc Hà Nội - Thái Nguyên và Vành đai 3 đoạn chạy trùng đường đi sân bay Gia Bình.