Tuy nhiên, sau đó nhà đầu tư lại bị Cơ quan Cảnh sát điều tra (C46) Bộ Công an điều tra về việc cố ý làm trái quy định của Nhà nước về quản lý kinh tế gây hậu quả nghiêm trọng, đồng thời Cơ quan Cảnh sát điều tra Bộ Công an đã thực hiện lệnh kê biên lô đất này. Năm 2014, theo đề nghị của UBND tỉnh Khánh Hòa, Bộ Công an đã gỡ lệnh kê biên để tạo điều kiện triển khai dự án. Tuy nhiên đến nay, khu đất vẫn bỏ hoang, nhếch nhác và hình thành một ao tù rộng hàng trăm m2 giữa trung tâm TP Nha Trang.
Ngày 17/4/2019, UBND tỉnh Khánh Hòa đã có thông báo khẩn giao Sở Xây dựng hướng dẫn chủ đầu tư dự án Nha Trang Golden Gate nghiên cứu hoàn thiện hồ sơ điều chỉnh phương án kiến trúc quy hoạch.